Validación de muestras, técnicas y estrategias de diagnóstico de virus emergentes (experiencia con COVID-19)

Kenji F. Shoji; Horacio Andres Aguirre-Villegas; Roxana Aleman Castillo; Rodrigo Karlop Arce Cardozo

Autores

Kenji F. Shoji Departamento de Farmacología Traslacional, Galapagos Pharma Autor/a https://orcid.org/0000-0002-8137-2521 (no autenticado)
Horacio Andres Aguirre-Villegas Departamento de Ingeniería de Sistemas Biológicos, Universidad de Wisconsin-Madison. Autor/a https://orcid.org/0000-0002-8746-2296 (no autenticado)
Roxana Aleman Castillo Universidad Autónoma Juan Misael Saracho Autor/a https://orcid.org/0000-0001-9523-8932 (no autenticado)
Rodrigo Karlop Arce Cardozo Instituto de Investigación Biomédica y Social, Facultad de Medicina “Aurelio Melean”, UMSS, Autor/a https://orcid.org/0000-0003-1129-414X (no autenticado)

Palabras clave:

reacción en cadena en tiempo real de la polimerasa, técnicas de laboratorio clínico, prueba de COVID-19, enfermedades virales

Resumen

Objetivos: actualmente, la técnica estándar de detección de virus qRT-PCR, requiere personal capacitado, equipos especializados y reactivos relativamente costosos. La técnica de amplificación isotérmica mediada por bucle, LAMP, ha resurgido como una alternativa prometedora previamente y durante la pandemia de COVID-19 y su estudio tiene potencial para el control de enfermedades infecciosas emergentes.

Métodos: en este trabajo, presentamos un estudio comparativo realizado por el SEDES de Tarija en octubre del 2020 donde se comparó muestras de pacientes voluntarios utilizando RT-PCR y LAMP en muestras de hisopados nasofaríngeos y de
saliva.

Resultados: LAMP demostró una concordancia del 100% con PCR en muestras de ARN nasofaríngeo, y un 93,5% de concordancia con muestras de saliva.

Conclusiones: el diagnóstico rápido y práctico de enfermedades infecciosas emergentes como el COVID-19 es crucial para establecer estrategias de control eficaces que minimicen el impacto económico y que a su vez maximicen la protección sobre sus ciudadanos. Nuestros resultados validan la sensibilidad de LAMP y el uso de muestras de saliva como alternativa menos invasiva. Este
trabajo confirma la validez de la técnica y su fácil implementación en áreas rurales con recursos limitados para el control de enfermedades virales emergentes.